Un resultado de las reacciones de hidroprocesamiento es la producción de sulfuro de hidrógeno y amoníaco de los contaminantes eliminados de los torrentes de hidrocarburo. Dado que el efluente del reactor para hidrotratamiento se enfría posteriormente mediante intercambiadores térmicos, el sulfuro de hidrógeno, el amonio y los cloruros (si están presentes) en la fase gaseosa, se combinarán y formarán bisulfato de amonio y cloruro de amonio. Que esto ocurra en el sistema de intercambiador dependerá de la concentración y la temperatura. Si se genera acumulación, es posible que se produzca corrosión bajo los depósitos.

Para minimizar la corrosión, las refinerías normalmente utilizan estrategias de enjuague con agua y monitoreo del sistema. Con un alto grado de contaminantes, los inhibidores de corrosión en películas pueden reducir la corrosión en la superficie del proceso, y los productos químicos para dispersar sales pueden minimizar el potencial de sedimentación en el sistema. La combinación puede ayudar a controlar la corrosión en los intercambiadores de efluentes del reactor.